Úřad tvoří tyto odbory:
odbor vnitřních věcí (OVV)
odbor finanční (OF)
odbor sociálních věcí (OSV)
odbor životního prostředí (OŽP)
odbor hospodářské správy a školství (OHSŠ)
odbor regionálního rozvoje (ORR)
odbor dopravy a silničního hospodářství (ODSH)
odbor živnostenského úřadu (OŽÚ)

a ostatní samostatné činnosti :
 - krizové řízení (KŘ) 
- odd.informačních technologií (IT)
- zajištění výroby a distribuce receptů a žádanek s modrým pruhem, evidence o výdeji, vrácení a znehodnocování vrácených receptů a žádanek